Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AFDNP55196 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AFDNP55196 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
AFDNP55196 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
AFDNP55196 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
AFDNP55196 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
AFDNP55196 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
AFDNP55196 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
AFDNP55196 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
AFDNP55196 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
AFDNP55196 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
AFDNP55196 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
AFDNP55196 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
AFDNP55196 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AFDNP55196 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
AFDNP55196 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
AFDNP55196 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
AFDNP55196 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AFDNP55196 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
AFDNP55196 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
AFDNP55196 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
AFDNP55196 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
AFDNP55196 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
AFDNP55196 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
AFDNP55196 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
AFDNP55196 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
AFDNP55196 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
AFDNP55196 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
AFDNP55196 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
AFDNP55196 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
AFDNP55196 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AFDNP55196 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
AFDNP55196 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AFDNP55196 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AFDNP55196 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
AFDNP55196 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
AFDNP55196 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
AFDNP55196 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
AFDNP55196 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
AFDNP55196 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
AFDNP55196 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
AFDNP55196 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
AFDNP55196 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
AFDNP55196 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
AFDNP55196 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
AFDNP55196 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
AFDNP55196 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
AFDNP55196 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
AFDNP55196 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
AFDNP55196 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
AFDNP55196 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
AFDNP55196 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
AFDNP55196 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
AFDNP55196 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
AFDNP55196 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
AFDNP55196 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
AFDNP55196 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
AFDNP55196 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
AFDNP55196 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
AFDNP55196 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
AFDNP55196 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
AFDNP55196 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
AFDNP55196 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
AFDNP55196 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
AFDNP55196 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
AFDNP55196 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
AFDNP55196 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
AFDNP55196 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
AFDNP55196 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
AFDNP55196 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
AFDNP55196 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
AFDNP55196 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
AFDNP55196 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
AFDNP55196 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
AFDNP55196 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
AFDNP55196 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
AFDNP55196 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
AFDNP55196 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
AFDNP55196 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
AFDNP55196 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
AFDNP55196 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
AFDNP55196 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
AFDNP55196 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
AFDNP55196 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
AFDNP55196 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
AFDNP55196 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
AFDNP55196 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
AFDNP55196 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
AFDNP55196 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
AFDNP55196 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
AFDNP55196 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
AFDNP55196 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
AFDNP55196 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
AFDNP55196 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
AFDNP55196 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
AFDNP55196 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
AFDNP55196 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
AFDNP55196 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
AFDNP55196 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
AFDNP55196 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms