Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHBP55084 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHBP55084 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHBP55084 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHBP55084 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHBP55084 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHBP55084 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHBP55084 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHBP55084 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHBP55084 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHBP55084 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHBP55084 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HADHBP55084 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HADHBP55084 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HADHBP55084 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HADHBP55084 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HADHBP55084 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HADHBP55084 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HADHBP55084 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HADHBP55084 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HADHBP55084 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HADHBP55084 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HADHBP55084 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HADHBP55084 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HADHBP55084 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HADHBP55084 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HADHBP55084 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HADHBP55084 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HADHBP55084 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HADHBP55084 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HADHBP55084 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HADHBP55084 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HADHBP55084 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HADHBP55084 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HADHBP55084 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HADHBP55084 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HADHBP55084 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HADHBP55084 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HADHBP55084 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HADHBP55084 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HADHBP55084 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HADHBP55084 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HADHBP55084 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HADHBP55084 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HADHBP55084 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HADHBP55084 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HADHBP55084 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HADHBP55084 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HADHBP55084 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HADHBP55084 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HADHBP55084 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HADHBP55084 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HADHBP55084 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HADHBP55084 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HADHBP55084 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HADHBP55084 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HADHBP55084 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HADHBP55084 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HADHBP55084 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HADHBP55084 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HADHBP55084 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HADHBP55084 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HADHBP55084 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HADHBP55084 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HADHBP55084 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HADHBP55084 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HADHBP55084 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HADHBP55084 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HADHBP55084 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HADHBP55084 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HADHBP55084 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HADHBP55084 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HADHBP55084 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HADHBP55084 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HADHBP55084 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HADHBP55084 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HADHBP55084 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HADHBP55084 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HADHBP55084 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HADHBP55084 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HADHBP55084 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HADHBP55084 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HADHBP55084 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HADHBP55084 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HADHBP55084 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HADHBP55084 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HADHBP55084 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HADHBP55084 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HADHBP55084 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HADHBP55084 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HADHBP55084 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HADHBP55084 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HADHBP55084 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HADHBP55084 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HADHBP55084 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HADHBP55084 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HADHBP55084 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HADHBP55084 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HADHBP55084 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HADHBP55084 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms