Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1B3P54709 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms