Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RARSP54136 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RARSP54136 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RARSP54136 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RARSP54136 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RARSP54136 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RARSP54136 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RARSP54136 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RARSP54136 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RARSP54136 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RARSP54136 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RARSP54136 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RARSP54136 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RARSP54136 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RARSP54136 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RARSP54136 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RARSP54136 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RARSP54136 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RARSP54136 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RARSP54136 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RARSP54136 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RARSP54136 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RARSP54136 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RARSP54136 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RARSP54136 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RARSP54136 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RARSP54136 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RARSP54136 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RARSP54136 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RARSP54136 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RARSP54136 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RARSP54136 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
RARSP54136 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
RARSP54136 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RARSP54136 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RARSP54136 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RARSP54136 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RARSP54136 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
RARSP54136 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RARSP54136 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RARSP54136 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
RARSP54136 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RARSP54136 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RARSP54136 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RARSP54136 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RARSP54136 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RARSP54136 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RARSP54136 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RARSP54136 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RARSP54136 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RARSP54136 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RARSP54136 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RARSP54136 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RARSP54136 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RARSP54136 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RARSP54136 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RARSP54136 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RARSP54136 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RARSP54136 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RARSP54136 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RARSP54136 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RARSP54136 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RARSP54136 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RARSP54136 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RARSP54136 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RARSP54136 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RARSP54136 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RARSP54136 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RARSP54136 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RARSP54136 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RARSP54136 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RARSP54136 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RARSP54136 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
RARSP54136 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RARSP54136 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RARSP54136 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RARSP54136 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RARSP54136 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RARSP54136 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RARSP54136 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RARSP54136 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RARSP54136 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RARSP54136 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
RARSP54136 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RARSP54136 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RARSP54136 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RARSP54136 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RARSP54136 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
RARSP54136 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RARSP54136 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RARSP54136 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RARSP54136 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RARSP54136 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RARSP54136 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RARSP54136 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RARSP54136 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RARSP54136 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RARSP54136 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RARSP54136 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RARSP54136 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms