Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA8P53708 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA8P53708 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms