Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KPNA1P52294 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms