Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT8P50990 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT8P50990 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT8P50990 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCT8P50990 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCT8P50990 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT8P50990 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT8P50990 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT8P50990 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT8P50990 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT8P50990 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT8P50990 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT8P50990 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT8P50990 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT8P50990 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT8P50990 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT8P50990 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT8P50990 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT8P50990 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT8P50990 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT8P50990 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT8P50990 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT8P50990 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT8P50990 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT8P50990 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT8P50990 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT8P50990 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT8P50990 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8P50990 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8P50990 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8P50990 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8P50990 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCT8P50990 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCT8P50990 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCT8P50990 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCT8P50990 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCT8P50990 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCT8P50990 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCT8P50990 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCT8P50990 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCT8P50990 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCT8P50990 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCT8P50990 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCT8P50990 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCT8P50990 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCT8P50990 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCT8P50990 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8P50990 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8P50990 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8P50990 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8P50990 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8P50990 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8P50990 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8P50990 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCT8P50990 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCT8P50990 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCT8P50990 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCT8P50990 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCT8P50990 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCT8P50990 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCT8P50990 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCT8P50990 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCT8P50990 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8P50990 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8P50990 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8P50990 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8P50990 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8P50990 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8P50990 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8P50990 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8P50990 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8P50990 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8P50990 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8P50990 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8P50990 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8P50990 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8P50990 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8P50990 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8P50990 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8P50990 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8P50990 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8P50990 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8P50990 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8P50990 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8P50990 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8P50990 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8P50990 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8P50990 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8P50990 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8P50990 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8P50990 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8P50990 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8P50990 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8P50990 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8P50990 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8P50990 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8P50990 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8P50990 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8P50990 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8P50990 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms