Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK1P49759 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK1P49759 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK1P49759 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK1P49759 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK1P49759 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK1P49759 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK1P49759 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK1P49759 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK1P49759 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK1P49759 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK1P49759 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK1P49759 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK1P49759 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK1P49759 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK1P49759 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK1P49759 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK1P49759 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK1P49759 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK1P49759 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK1P49759 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK1P49759 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK1P49759 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK1P49759 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK1P49759 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK1P49759 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK1P49759 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK1P49759 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK1P49759 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK1P49759 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK1P49759 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK1P49759 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK1P49759 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK1P49759 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK1P49759 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK1P49759 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK1P49759 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK1P49759 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK1P49759 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK1P49759 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK1P49759 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK1P49759 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK1P49759 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK1P49759 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK1P49759 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK1P49759 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK1P49759 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK1P49759 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK1P49759 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK1P49759 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK1P49759 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLK1P49759 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLK1P49759 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK1P49759 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK1P49759 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK1P49759 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK1P49759 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK1P49759 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK1P49759 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK1P49759 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK1P49759 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK1P49759 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK1P49759 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK1P49759 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK1P49759 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK1P49759 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK1P49759 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK1P49759 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK1P49759 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK1P49759 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK1P49759 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK1P49759 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK1P49759 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK1P49759 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK1P49759 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK1P49759 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK1P49759 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK1P49759 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK1P49759 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK1P49759 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK1P49759 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK1P49759 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK1P49759 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK1P49759 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK1P49759 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK1P49759 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms