Protein–RNA interactions for Protein: P49754

VPS41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS41P49754 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS41P49754 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS41P49754 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS41P49754 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS41P49754 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS41P49754 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS41P49754 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS41P49754 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS41P49754 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS41P49754 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS41P49754 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS41P49754 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS41P49754 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS41P49754 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS41P49754 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS41P49754 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS41P49754 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS41P49754 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS41P49754 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS41P49754 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS41P49754 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS41P49754 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS41P49754 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS41P49754 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS41P49754 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS41P49754 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS41P49754 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS41P49754 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS41P49754 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS41P49754 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS41P49754 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS41P49754 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS41P49754 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS41P49754 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS41P49754 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS41P49754 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS41P49754 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS41P49754 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS41P49754 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS41P49754 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS41P49754 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS41P49754 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS41P49754 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS41P49754 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS41P49754 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS41P49754 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS41P49754 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS41P49754 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS41P49754 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS41P49754 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS41P49754 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS41P49754 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS41P49754 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS41P49754 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS41P49754 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS41P49754 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS41P49754 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS41P49754 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS41P49754 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS41P49754 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS41P49754 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS41P49754 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS41P49754 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS41P49754 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS41P49754 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS41P49754 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS41P49754 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS41P49754 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS41P49754 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS41P49754 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS41P49754 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS41P49754 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS41P49754 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS41P49754 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS41P49754 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS41P49754 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS41P49754 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS41P49754 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS41P49754 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS41P49754 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS41P49754 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS41P49754 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS41P49754 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS41P49754 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS41P49754 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS41P49754 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms