Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMTP48728 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMTP48728 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMTP48728 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AMTP48728 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AMTP48728 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMTP48728 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMTP48728 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMTP48728 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMTP48728 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMTP48728 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMTP48728 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMTP48728 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMTP48728 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMTP48728 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMTP48728 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMTP48728 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMTP48728 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMTP48728 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMTP48728 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMTP48728 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMTP48728 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMTP48728 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMTP48728 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AMTP48728 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMTP48728 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMTP48728 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMTP48728 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMTP48728 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMTP48728 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMTP48728 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMTP48728 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMTP48728 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMTP48728 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMTP48728 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AMTP48728 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMTP48728 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AMTP48728 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMTP48728 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMTP48728 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMTP48728 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMTP48728 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMTP48728 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMTP48728 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMTP48728 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMTP48728 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMTP48728 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMTP48728 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMTP48728 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMTP48728 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMTP48728 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMTP48728 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMTP48728 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMTP48728 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMTP48728 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMTP48728 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMTP48728 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMTP48728 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMTP48728 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMTP48728 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AMTP48728 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMTP48728 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMTP48728 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMTP48728 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMTP48728 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMTP48728 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMTP48728 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMTP48728 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMTP48728 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMTP48728 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AMTP48728 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMTP48728 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMTP48728 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMTP48728 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMTP48728 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMTP48728 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMTP48728 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMTP48728 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMTP48728 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AMTP48728 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AMTP48728 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms