Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTTP42858 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTTP42858 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTTP42858 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTTP42858 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTTP42858 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HTTP42858 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTTP42858 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTTP42858 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTTP42858 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTTP42858 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HTTP42858 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HTTP42858 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
HTTP42858 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HTTP42858 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HTTP42858 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTTP42858 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTTP42858 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTTP42858 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HTTP42858 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTTP42858 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HTTP42858 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTTP42858 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTTP42858 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTTP42858 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTTP42858 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTTP42858 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTTP42858 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTTP42858 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTTP42858 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTTP42858 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTTP42858 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTTP42858 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTTP42858 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTTP42858 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTTP42858 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTTP42858 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTTP42858 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTTP42858 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTTP42858 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTTP42858 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTTP42858 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTTP42858 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTTP42858 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTTP42858 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTTP42858 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HTTP42858 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTTP42858 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTTP42858 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTTP42858 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTTP42858 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTTP42858 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTTP42858 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HTTP42858 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTTP42858 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HTTP42858 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTTP42858 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTTP42858 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTTP42858 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTTP42858 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTTP42858 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HTTP42858 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTTP42858 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTTP42858 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HTTP42858 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HTTP42858 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTTP42858 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTTP42858 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTTP42858 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTTP42858 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTTP42858 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTTP42858 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTTP42858 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTTP42858 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTTP42858 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTTP42858 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTTP42858 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTTP42858 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTTP42858 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTTP42858 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HTTP42858 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTTP42858 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTTP42858 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTTP42858 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTTP42858 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTTP42858 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTTP42858 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms