Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP3P42574 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP3P42574 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP3P42574 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP3P42574 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP3P42574 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP3P42574 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP3P42574 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP3P42574 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP3P42574 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP3P42574 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP3P42574 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP3P42574 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP3P42574 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP3P42574 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP3P42574 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP3P42574 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP3P42574 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP3P42574 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP3P42574 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP3P42574 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP3P42574 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP3P42574 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP3P42574 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP3P42574 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP3P42574 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP3P42574 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP3P42574 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP3P42574 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP3P42574 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP3P42574 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP3P42574 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP3P42574 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP3P42574 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP3P42574 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP3P42574 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP3P42574 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP3P42574 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP3P42574 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP3P42574 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP3P42574 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP3P42574 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP3P42574 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP3P42574 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP3P42574 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP3P42574 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP3P42574 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP3P42574 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP3P42574 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP3P42574 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP3P42574 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP3P42574 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP3P42574 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP3P42574 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP3P42574 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP3P42574 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP3P42574 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP3P42574 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP3P42574 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP3P42574 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP3P42574 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP3P42574 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP3P42574 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP3P42574 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP3P42574 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP3P42574 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP3P42574 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP3P42574 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP3P42574 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP3P42574 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP3P42574 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP3P42574 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP3P42574 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP3P42574 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP3P42574 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP3P42574 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP3P42574 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP3P42574 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP3P42574 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP3P42574 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP3P42574 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP3P42574 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP3P42574 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP3P42574 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP3P42574 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP3P42574 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP3P42574 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP3P42574 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP3P42574 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP3P42574 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP3P42574 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP3P42574 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP3P42574 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP3P42574 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP3P42574 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP3P42574 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP3P42574 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP3P42574 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP3P42574 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP3P42574 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms