Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHAP40939 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHAP40939 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHAP40939 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHAP40939 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HADHAP40939 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHAP40939 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHAP40939 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHAP40939 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHAP40939 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHAP40939 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHAP40939 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHAP40939 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHAP40939 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHAP40939 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHAP40939 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHAP40939 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHAP40939 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHAP40939 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHAP40939 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHAP40939 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHAP40939 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHAP40939 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHAP40939 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHAP40939 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHAP40939 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHAP40939 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHAP40939 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHAP40939 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHAP40939 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHAP40939 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHAP40939 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHAP40939 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHAP40939 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHAP40939 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHAP40939 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHAP40939 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHAP40939 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHAP40939 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHAP40939 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHAP40939 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHAP40939 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHAP40939 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHAP40939 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHAP40939 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHAP40939 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHAP40939 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHAP40939 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HADHAP40939 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HADHAP40939 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HADHAP40939 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HADHAP40939 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HADHAP40939 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HADHAP40939 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HADHAP40939 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HADHAP40939 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HADHAP40939 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHAP40939 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHAP40939 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHAP40939 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHAP40939 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHAP40939 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHAP40939 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHAP40939 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHAP40939 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHAP40939 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHAP40939 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHAP40939 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHAP40939 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHAP40939 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HADHAP40939 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HADHAP40939 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HADHAP40939 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HADHAP40939 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HADHAP40939 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HADHAP40939 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HADHAP40939 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HADHAP40939 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HADHAP40939 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHAP40939 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHAP40939 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHAP40939 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHAP40939 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHAP40939 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHAP40939 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHAP40939 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHAP40939 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHAP40939 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHAP40939 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HADHAP40939 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHAP40939 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHAP40939 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHAP40939 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHAP40939 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHAP40939 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHAP40939 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HADHAP40939 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HADHAP40939 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HADHAP40939 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HADHAP40939 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms