Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL4AP40617 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms