Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTRLP40313 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTRLP40313 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTRLP40313 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTRLP40313 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTRLP40313 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTRLP40313 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTRLP40313 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTRLP40313 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTRLP40313 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTRLP40313 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTRLP40313 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTRLP40313 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTRLP40313 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTRLP40313 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTRLP40313 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTRLP40313 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTRLP40313 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTRLP40313 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTRLP40313 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTRLP40313 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTRLP40313 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTRLP40313 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTRLP40313 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTRLP40313 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTRLP40313 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTRLP40313 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTRLP40313 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTRLP40313 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTRLP40313 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTRLP40313 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTRLP40313 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTRLP40313 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTRLP40313 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTRLP40313 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTRLP40313 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTRLP40313 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTRLP40313 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTRLP40313 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTRLP40313 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTRLP40313 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTRLP40313 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTRLP40313 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTRLP40313 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTRLP40313 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTRLP40313 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTRLP40313 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTRLP40313 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTRLP40313 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTRLP40313 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTRLP40313 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTRLP40313 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTRLP40313 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTRLP40313 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTRLP40313 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTRLP40313 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTRLP40313 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTRLP40313 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTRLP40313 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTRLP40313 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTRLP40313 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTRLP40313 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTRLP40313 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTRLP40313 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTRLP40313 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTRLP40313 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTRLP40313 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTRLP40313 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTRLP40313 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTRLP40313 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTRLP40313 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTRLP40313 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTRLP40313 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTRLP40313 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTRLP40313 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTRLP40313 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTRLP40313 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTRLP40313 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTRLP40313 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTRLP40313 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTRLP40313 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTRLP40313 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTRLP40313 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTRLP40313 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTRLP40313 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTRLP40313 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTRLP40313 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTRLP40313 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTRLP40313 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTRLP40313 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTRLP40313 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTRLP40313 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTRLP40313 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTRLP40313 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTRLP40313 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTRLP40313 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTRLP40313 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTRLP40313 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTRLP40313 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTRLP40313 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms