Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORAP35398 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORAP35398 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORAP35398 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORAP35398 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORAP35398 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORAP35398 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORAP35398 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORAP35398 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORAP35398 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORAP35398 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORAP35398 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORAP35398 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORAP35398 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RORAP35398 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RORAP35398 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RORAP35398 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RORAP35398 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RORAP35398 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RORAP35398 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RORAP35398 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RORAP35398 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RORAP35398 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RORAP35398 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RORAP35398 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RORAP35398 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RORAP35398 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORAP35398 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORAP35398 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORAP35398 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORAP35398 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORAP35398 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORAP35398 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORAP35398 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORAP35398 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORAP35398 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORAP35398 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORAP35398 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORAP35398 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORAP35398 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RORAP35398 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORAP35398 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORAP35398 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORAP35398 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORAP35398 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORAP35398 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORAP35398 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORAP35398 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORAP35398 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORAP35398 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORAP35398 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORAP35398 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORAP35398 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORAP35398 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORAP35398 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORAP35398 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORAP35398 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RORAP35398 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORAP35398 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORAP35398 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORAP35398 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RORAP35398 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RORAP35398 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RORAP35398 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RORAP35398 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RORAP35398 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RORAP35398 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RORAP35398 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RORAP35398 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RORAP35398 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORAP35398 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORAP35398 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RORAP35398 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORAP35398 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORAP35398 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORAP35398 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RORAP35398 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RORAP35398 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RORAP35398 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RORAP35398 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RORAP35398 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORAP35398 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORAP35398 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORAP35398 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORAP35398 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORAP35398 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORAP35398 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORAP35398 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORAP35398 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORAP35398 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORAP35398 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORAP35398 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORAP35398 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORAP35398 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORAP35398 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORAP35398 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORAP35398 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORAP35398 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORAP35398 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORAP35398 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms