Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCGF2P35227 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms