Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERCC5P28715 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms