Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GABRB3P28472 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms