Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
DNMT1P26358 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DNMT1P26358 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
DNMT1P26358 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms