Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTAFRP25105 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms