Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKCHP24723 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCHP24723 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms