Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PTPRGP23470 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRGP23470 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRGP23470 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
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