Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYF6P23409 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYF6P23409 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MYF6P23409 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYF6P23409 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYF6P23409 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYF6P23409 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYF6P23409 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYF6P23409 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MYF6P23409 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYF6P23409 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYF6P23409 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYF6P23409 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYF6P23409 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYF6P23409 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYF6P23409 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYF6P23409 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MYF6P23409 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYF6P23409 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYF6P23409 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYF6P23409 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYF6P23409 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYF6P23409 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYF6P23409 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYF6P23409 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MYF6P23409 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYF6P23409 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYF6P23409 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYF6P23409 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYF6P23409 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYF6P23409 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYF6P23409 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYF6P23409 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYF6P23409 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYF6P23409 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYF6P23409 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYF6P23409 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYF6P23409 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYF6P23409 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYF6P23409 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYF6P23409 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYF6P23409 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYF6P23409 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYF6P23409 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYF6P23409 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MYF6P23409 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYF6P23409 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYF6P23409 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYF6P23409 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYF6P23409 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYF6P23409 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYF6P23409 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MYF6P23409 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYF6P23409 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYF6P23409 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYF6P23409 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYF6P23409 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYF6P23409 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYF6P23409 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYF6P23409 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYF6P23409 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYF6P23409 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYF6P23409 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MYF6P23409 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYF6P23409 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYF6P23409 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYF6P23409 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYF6P23409 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYF6P23409 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MYF6P23409 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MYF6P23409 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MYF6P23409 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MYF6P23409 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MYF6P23409 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
MYF6P23409 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MYF6P23409 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYF6P23409 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYF6P23409 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYF6P23409 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MYF6P23409 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYF6P23409 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYF6P23409 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYF6P23409 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYF6P23409 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYF6P23409 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYF6P23409 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYF6P23409 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYF6P23409 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYF6P23409 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYF6P23409 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYF6P23409 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYF6P23409 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYF6P23409 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYF6P23409 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYF6P23409 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYF6P23409 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYF6P23409 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYF6P23409 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYF6P23409 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYF6P23409 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms