Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ITGA6P23229 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGA6P23229 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGA6P23229 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms