Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BPBP20851 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms