Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB4AP20338 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms