Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNA2P20248 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCNA2P20248 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA2P20248 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms