Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKB1P19838 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFKB1P19838 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKB1P19838 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms