Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XRCC1P18887 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XRCC1P18887 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms