Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRAP18433 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRAP18433 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRAP18433 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
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