Protein–RNA interactions for Protein: P16150

SPN, Leukosialin, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNP16150 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPNP16150 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPNP16150 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPNP16150 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPNP16150 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPNP16150 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPNP16150 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPNP16150 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPNP16150 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPNP16150 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPNP16150 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPNP16150 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPNP16150 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPNP16150 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPNP16150 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPNP16150 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPNP16150 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SPNP16150 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPNP16150 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPNP16150 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPNP16150 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPNP16150 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPNP16150 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPNP16150 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPNP16150 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPNP16150 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPNP16150 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPNP16150 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPNP16150 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPNP16150 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPNP16150 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPNP16150 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPNP16150 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPNP16150 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPNP16150 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPNP16150 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPNP16150 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPNP16150 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPNP16150 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPNP16150 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPNP16150 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPNP16150 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPNP16150 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPNP16150 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPNP16150 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPNP16150 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPNP16150 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPNP16150 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPNP16150 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPNP16150 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPNP16150 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPNP16150 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPNP16150 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPNP16150 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPNP16150 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPNP16150 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPNP16150 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPNP16150 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPNP16150 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPNP16150 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPNP16150 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPNP16150 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPNP16150 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPNP16150 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPNP16150 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPNP16150 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPNP16150 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPNP16150 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPNP16150 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SPNP16150 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SPNP16150 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPNP16150 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPNP16150 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPNP16150 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPNP16150 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SPNP16150 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPNP16150 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPNP16150 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPNP16150 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPNP16150 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPNP16150 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPNP16150 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPNP16150 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPNP16150 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPNP16150 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPNP16150 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SPNP16150 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPNP16150 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SPNP16150 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SPNP16150 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPNP16150 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPNP16150 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPNP16150 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPNP16150 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPNP16150 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPNP16150 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPNP16150 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPNP16150 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPNP16150 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPNP16150 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms