Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPGDP15428 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HPGDP15428 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPGDP15428 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPGDP15428 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDP15428 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPGDP15428 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPGDP15428 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPGDP15428 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPGDP15428 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPGDP15428 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPGDP15428 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HPGDP15428 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPGDP15428 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPGDP15428 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPGDP15428 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HPGDP15428 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPGDP15428 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPGDP15428 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPGDP15428 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPGDP15428 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPGDP15428 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPGDP15428 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPGDP15428 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPGDP15428 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPGDP15428 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPGDP15428 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPGDP15428 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HPGDP15428 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HPGDP15428 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDP15428 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDP15428 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDP15428 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDP15428 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDP15428 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDP15428 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDP15428 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDP15428 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDP15428 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDP15428 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDP15428 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDP15428 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPGDP15428 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPGDP15428 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPGDP15428 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPGDP15428 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPGDP15428 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HPGDP15428 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPGDP15428 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPGDP15428 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPGDP15428 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPGDP15428 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HPGDP15428 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPGDP15428 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPGDP15428 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPGDP15428 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPGDP15428 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPGDP15428 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDP15428 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDP15428 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDP15428 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDP15428 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDP15428 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDP15428 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDP15428 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPGDP15428 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPGDP15428 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPGDP15428 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPGDP15428 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPGDP15428 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPGDP15428 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPGDP15428 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDP15428 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDP15428 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDP15428 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDP15428 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDP15428 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDP15428 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDP15428 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPGDP15428 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPGDP15428 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPGDP15428 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPGDP15428 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPGDP15428 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPGDP15428 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPGDP15428 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPGDP15428 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms