Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DOBP13765 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-DOBP13765 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms