Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM1P13688 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM1P13688 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms