Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRP12270 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPRP12270 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPRP12270 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPRP12270 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPRP12270 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPRP12270 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPRP12270 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPRP12270 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPRP12270 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TPRP12270 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPRP12270 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPRP12270 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPRP12270 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRP12270 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRP12270 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRP12270 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRP12270 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRP12270 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRP12270 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRP12270 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRP12270 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRP12270 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRP12270 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRP12270 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRP12270 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRP12270 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRP12270 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRP12270 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRP12270 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRP12270 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRP12270 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRP12270 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRP12270 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRP12270 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRP12270 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRP12270 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRP12270 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRP12270 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRP12270 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRP12270 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRP12270 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRP12270 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRP12270 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPRP12270 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRP12270 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRP12270 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRP12270 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRP12270 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRP12270 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRP12270 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRP12270 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRP12270 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRP12270 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRP12270 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRP12270 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRP12270 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRP12270 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRP12270 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRP12270 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRP12270 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRP12270 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRP12270 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRP12270 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRP12270 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRP12270 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRP12270 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRP12270 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRP12270 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRP12270 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRP12270 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRP12270 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRP12270 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRP12270 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRP12270 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRP12270 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRP12270 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRP12270 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRP12270 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRP12270 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRP12270 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRP12270 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRP12270 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRP12270 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRP12270 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRP12270 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRP12270 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRP12270 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRP12270 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRP12270 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRP12270 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRP12270 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRP12270 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRP12270 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRP12270 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRP12270 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRP12270 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRP12270 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRP12270 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRP12270 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms