Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LAMC1P11047 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LAMC1P11047 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMC1P11047 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LAMC1P11047 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms