Protein–RNA interactions for Protein: P10644

PRKAR1A, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1AP10644 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAR1AP10644 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAR1AP10644 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKAR1AP10644 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKAR1AP10644 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAR1AP10644 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAR1AP10644 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAR1AP10644 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms