Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMIGD3P0DMS9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms