Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGA3P0DJD8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGA3P0DJD8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms