Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC4LP0CB38 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPC4LP0CB38 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC4LP0CB38 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms