Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CSF1RP07333 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSF1RP07333 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms