Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3DP05423 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLR3DP05423 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3DP05423 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms