Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYBBP04839 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYBBP04839 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYBBP04839 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYBBP04839 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYBBP04839 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYBBP04839 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CYBBP04839 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYBBP04839 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYBBP04839 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYBBP04839 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYBBP04839 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYBBP04839 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYBBP04839 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYBBP04839 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYBBP04839 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYBBP04839 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYBBP04839 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYBBP04839 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYBBP04839 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CYBBP04839 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CYBBP04839 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CYBBP04839 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYBBP04839 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYBBP04839 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYBBP04839 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYBBP04839 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYBBP04839 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYBBP04839 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYBBP04839 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYBBP04839 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYBBP04839 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYBBP04839 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYBBP04839 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYBBP04839 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYBBP04839 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYBBP04839 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYBBP04839 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYBBP04839 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYBBP04839 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYBBP04839 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYBBP04839 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYBBP04839 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYBBP04839 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYBBP04839 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYBBP04839 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYBBP04839 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYBBP04839 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYBBP04839 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYBBP04839 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYBBP04839 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYBBP04839 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYBBP04839 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYBBP04839 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYBBP04839 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYBBP04839 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYBBP04839 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYBBP04839 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYBBP04839 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYBBP04839 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYBBP04839 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYBBP04839 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYBBP04839 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYBBP04839 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYBBP04839 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYBBP04839 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYBBP04839 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYBBP04839 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYBBP04839 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYBBP04839 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYBBP04839 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYBBP04839 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYBBP04839 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYBBP04839 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYBBP04839 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYBBP04839 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYBBP04839 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYBBP04839 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYBBP04839 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYBBP04839 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYBBP04839 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYBBP04839 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYBBP04839 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYBBP04839 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYBBP04839 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYBBP04839 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYBBP04839 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYBBP04839 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYBBP04839 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYBBP04839 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYBBP04839 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYBBP04839 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYBBP04839 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYBBP04839 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYBBP04839 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYBBP04839 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CYBBP04839 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYBBP04839 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYBBP04839 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYBBP04839 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms