Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYF2O95926 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYF2O95926 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYF2O95926 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYF2O95926 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYF2O95926 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYF2O95926 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYF2O95926 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYF2O95926 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYF2O95926 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYF2O95926 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYF2O95926 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYF2O95926 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYF2O95926 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYF2O95926 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYF2O95926 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYF2O95926 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYF2O95926 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYF2O95926 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYF2O95926 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYF2O95926 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYF2O95926 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYF2O95926 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYF2O95926 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYF2O95926 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYF2O95926 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYF2O95926 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYF2O95926 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYF2O95926 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYF2O95926 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYF2O95926 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYF2O95926 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYF2O95926 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYF2O95926 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYF2O95926 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYF2O95926 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYF2O95926 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYF2O95926 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYF2O95926 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYF2O95926 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYF2O95926 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYF2O95926 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYF2O95926 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYF2O95926 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYF2O95926 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYF2O95926 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYF2O95926 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYF2O95926 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYF2O95926 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYF2O95926 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYF2O95926 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYF2O95926 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYF2O95926 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYF2O95926 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYF2O95926 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYF2O95926 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYF2O95926 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYF2O95926 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYF2O95926 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYF2O95926 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYF2O95926 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYF2O95926 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYF2O95926 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYF2O95926 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYF2O95926 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYF2O95926 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYF2O95926 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYF2O95926 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYF2O95926 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYF2O95926 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYF2O95926 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYF2O95926 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYF2O95926 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYF2O95926 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYF2O95926 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYF2O95926 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYF2O95926 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYF2O95926 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYF2O95926 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYF2O95926 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms