Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF12O95522 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF12O95522 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms