Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAPGEF3O95398 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
RAPGEF3O95398 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF3O95398 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF3O95398 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF3O95398 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF3O95398 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF3O95398 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAPGEF3O95398 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
RAPGEF3O95398 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAPGEF3O95398 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RAPGEF3O95398 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RAPGEF3O95398 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RAPGEF3O95398 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms