Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB11O95342 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCB11O95342 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCB11O95342 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCB11O95342 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCB11O95342 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ABCB11O95342 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB11O95342 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB11O95342 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB11O95342 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB11O95342 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB11O95342 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB11O95342 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB11O95342 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB11O95342 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB11O95342 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB11O95342 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB11O95342 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCB11O95342 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCB11O95342 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCB11O95342 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms