Protein–RNA interactions for Protein: O75628

REM1, GTP-binding protein REM 1, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REM1O75628 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REM1O75628 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REM1O75628 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REM1O75628 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
REM1O75628 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
REM1O75628 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REM1O75628 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REM1O75628 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REM1O75628 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REM1O75628 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REM1O75628 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REM1O75628 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REM1O75628 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REM1O75628 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REM1O75628 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
REM1O75628 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REM1O75628 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REM1O75628 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REM1O75628 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REM1O75628 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REM1O75628 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REM1O75628 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REM1O75628 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REM1O75628 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REM1O75628 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REM1O75628 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REM1O75628 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REM1O75628 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REM1O75628 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
REM1O75628 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REM1O75628 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REM1O75628 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REM1O75628 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REM1O75628 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REM1O75628 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REM1O75628 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REM1O75628 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REM1O75628 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REM1O75628 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REM1O75628 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REM1O75628 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REM1O75628 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REM1O75628 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REM1O75628 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REM1O75628 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REM1O75628 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REM1O75628 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REM1O75628 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REM1O75628 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REM1O75628 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REM1O75628 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REM1O75628 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REM1O75628 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REM1O75628 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REM1O75628 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REM1O75628 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REM1O75628 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REM1O75628 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REM1O75628 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REM1O75628 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
REM1O75628 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REM1O75628 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REM1O75628 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REM1O75628 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REM1O75628 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REM1O75628 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REM1O75628 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REM1O75628 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
REM1O75628 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REM1O75628 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REM1O75628 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REM1O75628 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REM1O75628 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REM1O75628 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REM1O75628 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REM1O75628 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REM1O75628 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REM1O75628 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REM1O75628 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REM1O75628 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REM1O75628 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REM1O75628 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REM1O75628 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
REM1O75628 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
REM1O75628 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REM1O75628 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REM1O75628 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
REM1O75628 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REM1O75628 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
REM1O75628 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
REM1O75628 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
REM1O75628 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
REM1O75628 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REM1O75628 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REM1O75628 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REM1O75628 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REM1O75628 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REM1O75628 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REM1O75628 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REM1O75628 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms