Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP2O75604 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP2O75604 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP2O75604 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP2O75604 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP2O75604 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
USP2O75604 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
USP2O75604 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP2O75604 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP2O75604 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP2O75604 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP2O75604 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
USP2O75604 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP2O75604 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP2O75604 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP2O75604 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP2O75604 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
USP2O75604 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP2O75604 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP2O75604 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP2O75604 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP2O75604 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP2O75604 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP2O75604 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP2O75604 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP2O75604 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP2O75604 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP2O75604 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP2O75604 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP2O75604 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP2O75604 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP2O75604 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP2O75604 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP2O75604 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP2O75604 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP2O75604 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP2O75604 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP2O75604 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP2O75604 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP2O75604 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP2O75604 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP2O75604 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP2O75604 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP2O75604 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP2O75604 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
USP2O75604 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
USP2O75604 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP2O75604 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP2O75604 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP2O75604 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP2O75604 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP2O75604 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP2O75604 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP2O75604 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP2O75604 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP2O75604 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP2O75604 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP2O75604 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP2O75604 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP2O75604 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP2O75604 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP2O75604 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP2O75604 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP2O75604 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP2O75604 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP2O75604 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP2O75604 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP2O75604 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP2O75604 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP2O75604 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP2O75604 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP2O75604 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP2O75604 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP2O75604 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP2O75604 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP2O75604 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP2O75604 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP2O75604 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP2O75604 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP2O75604 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP2O75604 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP2O75604 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP2O75604 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP2O75604 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP2O75604 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP2O75604 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP2O75604 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP2O75604 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP2O75604 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP2O75604 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP2O75604 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP2O75604 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP2O75604 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP2O75604 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP2O75604 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP2O75604 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP2O75604 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP2O75604 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP2O75604 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP2O75604 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms